units           metal          # Angstrom, eV, ps, bar
boundary        p p p          # Περιοδικό σύστημα.
atom_style      atomic         # Τύπος σωματιδίων στην προσομοίωση.

#-----------------------------------------------------------------------
#  Κρυσταλλικό σύστημα και πλεγματική σταθερά.
#-----------------------------------------------------------------------
lattice         fcc 3.63

#-----------------------------------------------------------------------
#  Επανάληψη στις τρείς διευθύνσεις και τοποθέτηση ατόμων.
#-----------------------------------------------------------------------
region          my_box block 0 5 0 5 0 5
create_box      1 my_box
create_atoms    1 box
displace_atoms  all move 0.9 0.9 0.9 units box

#-----------------------------------------------------------------------
#  Ορισμός δυναμικού αλληλεπίδρασης.
#-----------------------------------------------------------------------
pair_style      eam
pair_coeff      * * Cu.eam 

#-----------------------------------------------------------------------
#  Ποιές θερμοδυναμικές πληροφορίες θα εμφανιστούν στην οθόνη.
#-----------------------------------------------------------------------
thermo_style    custom step temp pe press lx ly lz
thermo          1

#-----------------------------------------------------------------------
#  Ορισμός στατιστικού συνόλου (ισόθερμο-ισοβαρές NPT).
#-----------------------------------------------------------------------
fix             my_npt all npt temp 300 300 0.01 iso 0 0 1

#-----------------------------------------------------------------------
#  Ορισμός αρχικών ταχυτήτων.
#-----------------------------------------------------------------------
velocity        all create 600 4928459 mom yes rot yes dist gaussian

#-----------------------------------------------------------------------
#  Χρονικό βήμα (σε ps)
#-----------------------------------------------------------------------
timestep        0.002

#-----------------------------------------------------------------------
#  Πως να γράφεται η τροχιά.
#-----------------------------------------------------------------------
dump            my_trajectory all custom 5 t.lammpstrj id x y z type
dump_modify     my_trajectory sort id

#-----------------------------------------------------------------------
#  Αρχικός υπολογισμός ενέργειας και θερμοδυναμικών ποσοτήτων.
#-----------------------------------------------------------------------
run             0

#-----------------------------------------------------------------------
#  Αρχική ισορροπία του συστήματος.
#-----------------------------------------------------------------------
##run             10000

#-----------------------------------------------------------------------
#  Παραγωγή τροχιάς.
#-----------------------------------------------------------------------
##run             10000