units           metal          # Angstrom, eV, ps, bar
boundary        p p p          # Περιοδικό σύστημα.
atom_style      atomic         # Τύπος σωματιδίων στην προσομοίωση.

#-----------------------------------------------------------------------
#  Κρυσταλλικό σύστημα και πλεγματική σταθερά.
#-----------------------------------------------------------------------
lattice         fcc 3.6

#-----------------------------------------------------------------------
#  Επανάληψη στις τρείς διευθύνσεις και τοποθέτηση ατόμων.
#-----------------------------------------------------------------------
region          my_box block 0 5 0 5 0 5
create_box      1 my_box
create_atoms    1 box
#displace_atoms  all move 0.9 0.9 0.9 units box

#-----------------------------------------------------------------------
#  Ορισμός δυναμικού αλληλεπίδρασης.
#-----------------------------------------------------------------------
pair_style      eam
pair_coeff      * * Cu.eam 

#-----------------------------------------------------------------------
#  Ποιές θερμοδυναμικές πληροφορίες θα εμφανίστούν στην οθόνη.
#-----------------------------------------------------------------------
thermo_style    custom step temp pe press lx ly lz
thermo          1

#-----------------------------------------------------------------------
#  Υπολογισμός της δυναμικής ενέργειας.
#-----------------------------------------------------------------------
run             0

#-----------------------------------------------------------------------
#  Αποθήκευση συντεταγμένων.
#-----------------------------------------------------------------------
write_dump      all custom cu.lammpstrj id x y z type

#-----------------------------------------------------------------------
#  Εύρεση του ελαχίστου της ενέργειας με αριθμητικές μεθόδους.
#-----------------------------------------------------------------------
#fix             min all box/relax iso 0
#minimize        1.e-8 1.e-8 1000 1000